Cependant, du côté paternel, il était le neveu de Juan de Dios Amador, gouverneur de Carthagène pendant le siège de Morillo, et Martin Amador, exécuté par les Espagnols en 1816.

Manuel Amador né de l'union de José Maria Amador Guerrero et Mercedes et Cordoue. Il a étudié la médecine à l'Université de Cartagena et a émigré au Panama en 1855, année où il a ouvert le chemin de fer de l'isthme, qui a apporté la prospérité par rapport à ce département, devenu un carrefour pour les produits américains et les personnes au cours de la «ruée vers l'or". Amador a travaillé comme médecin de la Compagnie des chemins de fer, l'entreprise qui a fait toutes les discussions qui ont favorisé, des années plus tard, la séparation de l'isthme de Colombie. Son mariage avec Maria de la Ossa lié par les familles de l’ oligarchie isthmique commerciale.

Dans les années soixante, Amador apparaît dans la politique locale dans les rangs du Parti conservateur, qui a déclaré d'importantes fonctions publiques: membre du Congrès par la province de Veraguas, d'abord désigner l'Etat souverain du Panama, en 1866, président en 1867, mais n'a pas pu exercer ses fonctions, chef par intérim civile et militaire en 1886, assistant gouverneur Victor Salazar, lors de la guerre des Mille Jours, proposé par ce dernier en tant que membre du Sénat de 1902 à 1903, une position qui a été prise par le vice Marroquín, qui est, comme Lemaitre, l'un de ses mobiles personnels pour promouvoir la «séparation».

Son activisme conservateur, les liens familiaux et les relations étroites avec les intérêts américains peut expliquer pourquoi il a joué un rôle clé dans le moment crucial où le gouvernement a décidé de prendre en charge Theodore Roosevelt à construire le canal de Panama, après le Congrès de Colombie rejetée, le 12 Août 1903, le traité Hay-Herran Et pourtant, selon Ovidio Diaz, «à première vue, le Dr Manuel Amador Guerrero semblait un candidat improbable pour mener une révolution."