Toda la operación del Canal de Panamá está sustentada por las reservas de agua de su cuenca hidrográfica, a la que contribuyen numerosos ríos. Para mantener esas fuentes fluviales, la vía acuática está situada dentro de una zona selvática protegida de 16 kilómetros de ancho, que corre a lo largo de los 80 kilómetros de extensión de la franja canalera. Hay varios sitios en dicha zona en los que se puede observar la abundante biodiversidad del bosque tropical lluvioso, entre ellos el Parque Nacional Soberanía, el Sendero del Oleoducto, el Jardín Botánico Summit, la isla de Barro Colorado, el Sendero El Charco, el Sendero Camino de Cruces, el Sendero de la Laguna y el Parque Nacional Chagres.